חיילים שהחלו לגדל זקן רק בתחילת החג מחויבים לגלחו למרות ספירת העומר, בנימוק כי האישור לגידול זקן ניתן אך ורק למי שמקיימים בקביעות אורח חיים דתי. צה"ל החמיר לאחרונה את ההנחיות בעניין גידול זקנים בקרב חייליו, גם בתקופת ספירת העומר. עד היום כל חייל שביקש לגדל זקן בתקופת ספירת העומר קיבל אישור לכך.
ההוראות בנושא נכנסו לתוקפן לאחרונה, והחל מ-1 באפריל אוכפת אותן המשטרה הצבאית, לאחר חידוד ההנחיות בקרב יחידות הצבא. בקול ישראל אף דווח כי באחד הבסיסים התנו המפקדים את היציאה לחופשת החג בגילוח הזקן.
על-פי ההוראות החדשות, חייל שמקיים אורח חיים דתי ואינו מגדל זקן בשיגרה יוכל להאריך את שיער פניו במועדים דוגמת ימי ספירת העומר ובין המצרים. ההוראה אינה מתייחסת לחיילים באבל על בן משפחה. משרתים שאיבדו אחד מהוריהם יורשו לגדל זקן במשך עד 90 יום, ופטור ל-30 יום יינתן לחייל שנפטר אחד מקרוביו שעליו חייב להתאבל.
להוראה החדשה קדמה עבודת מטה שהתקיימה בשנה האחרונה בראשות מפקד בסיס מטכ"ל, אל"ם גולן מימון, ובשיתוף מפקדים, גורמי הרבנות הצבאית הראשית, חיל הרפואה והפרקליטות הצבאית.
ראש ענף משטר ומשמעת בצה"ל הוציא איגרת המפרטת הוראות חדשות בכל הקשור לגידול זקן, וקובעת כי רק חיילים המקיימים אורח חיים דתי יורשו לעשות זאת. באיגרת נאמר כי בשנתיים האחרונות נרשם גידול של ממש במספר החיילים שביקשו לגדל זקן מטעמים שונים. "גידול זקן שלא על-פי ההוראות פוגע במשמעת חיילי צה"ל ובתדמיתם בעיני אזרחי ישראל", נכתב באיגרת.